Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA3AA6NCI4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA3AA6NCI4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3AA6NCI4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms