Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms