Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB19A4D1S5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB19A4D1S5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms