Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC144AA2RUR9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC144AA2RUR9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC144AA2RUR9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms