Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLRN2A0PK11 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLRN2A0PK11 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.5 ms