Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM72A0PK05 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM72A0PK05 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms