Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRBC2A0A5B9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBC2A0A5B9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBC2A0A5B9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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