Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCRBV5S1A1TA0A578 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV5S1A1TA0A578 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms