Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRACR2AQ9BSW2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms