Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms