Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARRDC4Q8NCT1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARRDC4Q8NCT1 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms