Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC097658.2-201ENST00000512715 624 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LINC02381-202ENST00000635070 1341 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC090587.1-201ENST00000415809 494 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 RN7SL105P-201ENST00000475661 299 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AL021407.3-201ENST00000407522 486 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 OPRM1-211ENST00000518759 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SULT1A3-202ENST00000395138 1326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms