Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PCSK1-202ENST00000508626 2234 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PKD2L1-201ENST00000318222 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CTLA4-202ENST00000302823 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AL117378.1-201ENST00000454596 2305 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LINC01119-202ENST00000468141 2157 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 MAB21L2-201ENST00000317605 2772 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 IQCK-202ENST00000320394 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 C8B-206ENST00000543257 2382 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 HSPA14-202ENST00000437161 1689 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 GRHL3-203ENST00000356046 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC068775.1-201ENST00000322446 2142 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AP001150.1-201ENST00000558822 2128 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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