Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
RPS29P62273 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
RPS29P62273 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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