Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCAP28676 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCAP28676 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCAP28676 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms