Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLD1P28340 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLD1P28340 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms