Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LTAP01374 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LTAP01374 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
LTAP01374 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LTAP01374 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LTAP01374 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
LTAP01374 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LTAP01374 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LTAP01374 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LTAP01374 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LTAP01374 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LTAP01374 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms