Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SCN2BO60939 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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