Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms