Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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