Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXQ1Q9C009 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms