Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DNM3-206ENST00000520906 4454 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms