Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms