Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RTL8BQ17RB0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RTL8BQ17RB0 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RTL8BQ17RB0 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RTL8BQ17RB0 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RTL8BQ17RB0 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RTL8BQ17RB0 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RTL8BQ17RB0 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RTL8BQ17RB0 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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