Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms