Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ERVS71-1P61550 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ERVS71-1P61550 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms