Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms