Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms