Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM21P19474 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms