Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYN1P17600 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYN1P17600 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYN1P17600 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYN1P17600 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYN1P17600 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYN1P17600 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYN1P17600 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYN1P17600 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SYN1P17600 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SYN1P17600 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYN1P17600 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYN1P17600 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYN1P17600 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYN1P17600 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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