Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms