Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SULT1A3-202ENST00000395138 1326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116903.2-201ENST00000561674 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL138762.1-201ENST00000608554 1637 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P39-201ENST00000415349 1299 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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