Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
A4GALTQ9NPC4 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms