Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LRRC61Q9BV99 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms