Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms