Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms