Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 PTAFR-201ENST00000305392 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms