Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms