Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGNL1Q0VF96 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms