Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms