Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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