Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASA1P20936 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASA1P20936 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASA1P20936 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms