Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms