Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms