Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL354707.1-201ENST00000615168 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms