Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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BIVM-ERCC5R4GMW8 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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BIVM-ERCC5R4GMW8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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BIVM-ERCC5R4GMW8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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BIVM-ERCC5R4GMW8 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068987.3-201ENST00000637934 1195 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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