Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 IGSF3-203ENST00000369486 7254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PLEKHA6-205ENST00000637508 5704 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms