Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms