Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms