Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRRC36Q1X8D7 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRRC36Q1X8D7 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms